На главную страницу сайта Опыты по химии Химический Юмор. Научный Юмор Опыты по физике    



Форум Химиков - Энтузиастов. Химия и Химики

Эксперименты по Химии - Практическая Химия - Книги по Химии - Физика – Астрономия – Биология – Научный Юмор
Прежде чем отправить свое сообщение - ознакомьтесь с ПРАВИЛАМИ ФОРУМА.
Прежде чем создать новую тему - воспользуйтесь ПОИСКОМ, возможно, аналогичная тема уже есть

All times are UTC [ DST ]




Post new topic Reply to topic  [ 145 posts ]  Go to page 1, 2, 3, 4, 5 ... 8  Next
Author Message
 Post subject: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 27 Jun 2012 06:31 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
Сама статья здесь http://www.moscowuniversityclub.ru/home.asp?artId=11966
Обидно, что данное движение полностью отсутствует в на территории бывшего СССР.
По большому счету, в научных исследованиях у себя дома нет ничего экстраординарного. Например, сегодня в России научная деятельность не лицензируется. То есть, формально любой человек может создать свою лабораторию, зарегистрировать ее как некоммерческую организацию и подавать заявки, например, на гранты Российского фонда фундаментальных исследований. И не факт, что такая структура будет менее эффективна, чем крупный университет или исследовательский центр.

Эта тема обсуждалась на просторах Интернета, но хотелось поговорить об этом с химиками.
P.S.
Жду амплификатор и блок питания для электрофореза, как только получу эти приборы попробую развернуть, тему более подробно.
Камеру для электрофореза склею сам, чуть позже выложу ее чертежи.


Attachments:
Garage_biology_ru.jpg
Garage_biology_ru.jpg [ 94.25 KiB | Viewed 26527 times ]

_________________
http://www.microscopist.info/
Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 27 Jun 2012 06:58 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
ImageМолекулярная клиническая диагностика. Методы
Херрингтон С., Макги Дж.
Раздел: Методы исследования
В книге авторитетного коллектива авторов из Англии, Голландии, Испании, США и других стран подробно описаны новейшие молекулярно-диагностические методы, которые находят все более широкое применение в клинических лабораториях. Среди них: иммуноцитохимическое генотипирование клеток и его использование для диагностики раковых заболеваний; гибридизация in situ, позволяющая обнаруживать специфические нуклеиновые кислоты в интактных клетках, срезах тканей и мазках; полимеразная цепная реакция и ее применение для выявления минимальных количеств вирусной ДНК в тканях и цитологических препаратах. Описаны также методы определения отцовства и идентификации личности.
Для иммунологов, вирусологов, онкологов, молекулярных биологов.

DJVU, 558 стр., 1999 г.
Артикул: 011319
Размер архива: 8,16 Мб
http://chemistry-chemists.com/book5/biologija-medicina-popular/Molekuljarnaja_Klinicheskaja_Diagnostika.djvu

_________________
http://www.microscopist.info/


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 27 Jun 2012 07:07 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
Анализ генома. Методы, К.Дейвис
Сборник молекулярно-биологнческих методов, используемых при изучении генома человека, написанный коллективом авторов из США и Великобритании. Изложению каждого метода предшествует краткое теоретическое введение, что делает книгу доступной для начинающих исследователей.
Описаны методы трансфекцни эукариотических клеток; рестрикционное картирование; технология больших молекул ДНК; выявление единичных замен нук-леотидов в ДНК; проведение полимеразной цепной реакции получения ДНК; генная дактилоскопия.
Для молекулярных биологов и генетиков.

Авторы: К.Дейвис
Название: Анализ генома. Методы
Размер: 4,35 Mb
Тип файла djvu
Вид документа: Учебное пособие

http://chemistry-chemists.com/book5/biologija-medicina-popular/Analiz_genoma_Metody.djvu


Image Методики для работ по генетической инженерии
Автор(ы): Мазин А. В.
Год изд.: 1986
Описание:
Настоящий материал издается по инициативе комплексного творческого молодежного коллектива (KMC) и написан в основном его членами. Необходимость написания такого материала связана с очень быстрым развитием методов молекулярной генетики и генетической инженерии и внедрением их во многие отрасли биологической науки. Молекулярно-генетические методы довольно трудоемки и, чтобы ими овладеть, требуются, как правило, значительные усилия и время. Предлагаемый материал был задуман как собрание кратких лаконично неписаных методичек. Для написания данного материала были привлечены квалифицированные сотрудники, имеющие опыт работы с рекомбинантными ДНК. Поэтому многие, если не большинство разделов, содержат усовершенствования или элементы оригинальных авторских разработок.

http://chemistry-chemists.com/book5/biologija-medicina-popular/Metodiki_dlja_raboty_po_gennoj_inzhenerii.djvu

_________________
http://www.microscopist.info/


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 30 Jun 2012 16:35 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Кстати, нашёл где достать бесплатные образцы плазмид для опытов с E. coli: http://www.aldevron.com/products/dnas/plasmids/ Заказал. Мне вот сейчас пришли образцы pRc/CMV-Hbs(S) и pCMVHB-S2.S. Расписан протокол работы, для одной из плазмид даже дана подробная карта, обе они основаны на pBlueScript и несут ген устойчивости к ампициллину. В общем: кому надо - заказывайте, доставляемость до адресата подтверждаю.) Кстати, коллекционерам марок ещё марки на конверте понравятся.)

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 30 Jun 2012 19:11 
Offline
.
User avatar

Joined: 04 Nov 2009 22:05
Posts: 62193
Location: Моя Батьківщина там, де моя лабораторія
Уже давно хотел написать, но все никак не доходили руки. Хотелось бы посмотреть на вопрос гораздо шире.

Что нужно химику для работы? Приспособленное помещение, реактивы и элементарное оборудование.

Что я имею в "родном" НИИ? Помещение, муфель, вытяжки и сушильный шкаф - все. Нет ни плитки, ни рН-метра, ни даже технических весов. За всем этим нужно бегать каждый раз с третьего этажа на первый и каждый раз к кому-то проситься.

Плитка стоит 120-200 гривен, от силы - 300, технические весы - пару сотен, портативный рН-метр - гривен 500. Наверняка все это придется покупать за свои деньги. С реактивами аналогично: либо нужный случайно есть, либо его нужно просить у соседа, либо покупать за свои деньги (выменивать). Другими совами, все кроме помещения и крупногабаритного оборудования приходится иметь свое.

Хорошо, но если так, то зачем иметь над собой подлое и истерическое начальство, бухгалтерию, которая непрерывно ворует, слесарей, которые только "синячат", но если нужно что-то сделать - и не пошевелятся? Ради 2000 гривен в месяц? Но их можно заработать в массе других мест.

Идеальным вариантом была бы группа энтузиастов со своим - причем портативным - оборудованием, чтобы в случае любых серьезных проблем его можно было быстро собрать и помахать институтскому начальству ручкой. Уже есть не только портативные весы и рН-метры, но и ИК-спектрометры, масс-спектрометры и т.д. А даже если и нет прибора, за анализы и так часто приходится платить наличными - так какой толк от надстройки под названием "АН"?

_________________
Думайте!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 30 Jun 2012 21:06 
Offline
Участник
Участник
User avatar

Joined: 18 Nov 2010 13:57
Posts: 132
Location: Пермь
labx, идея собственной лаборатории биологической очень злободневна. Но, имхо, очень вероятны проблемы с химической стороны.
1) Прекурсоры - никогда не ясно, что может оказаться в очередной редакции списка.
2) Отсутствие собственной тонкой химической промышленности и, как следствие, поставщиков различных достаточно сложных реактивов без которых не будет ни молекулярной биологии, ни всего остального.

2Dorif
Одной плазмиды для опытов маловато будет. Как планируете решать проблему с остальными необходимыми реактивами?

P.S. На трекере лежит запас хороших журналов по молекулярной биологии:
http://chemistry-chemists.com/f5/viewtopic.php?f=18&t=40
Более полная коллекция находится на рутрекере.


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 01 Jul 2012 02:36 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
jnik wrote:
2Dorif
Одной плазмиды для опытов маловато будет. Как планируете решать проблему с остальными необходимыми реактивами?

P.S. На трекере лежит запас хороших журналов по молекулярной биологии:
http://chemistry-chemists.com/f5/viewtopic.php?f=18&t=40
Более полная коллекция находится на рутрекере.

Ну, для метода трансформации тепловым шоком не надо реактивов для трангсфекции.) А в случае чего - и их можно бесплатными образцами выпросить.) Одно плохо: не знаю, где буферы Гуда взять. Может есть у кого пособие по синтезу оных? Или может кто знает, чем заменить? Тот же трис нужно заменить как-то. Он для экстракции плазмид нужен. Ну и ЭДТА(этого - хоть топись, у нас неорганики комплексами занимаются и этого добра у них навалом).

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 02 Jul 2012 03:36 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
jnik wrote:
labx, идея собственной лаборатории биологической очень злободневна. Но, имхо, очень вероятны проблемы с химической стороны.
1) Прекурсоры - никогда не ясно, что может оказаться в очередной редакции списка.
2) Отсутствие собственной тонкой химической промышленности и, как следствие, поставщиков различных достаточно сложных реактивов без которых не будет ни молекулярной биологии, ни всего остального.


Не буду хвастаться) я решаю проблему с прекурсорами уже многие годы без всяких проблем.
по моему опыту, вопрос не в отсутствии собственной тонкой химпромышленности, а в отсутствии денег, в Москве просто не реально снять помещение за приемлемые деньги.
Дачный вариант, мной сейчас прорабатывается, но опять эта трата времени, сил и денег.
Знаю пару биохимиков которые хотят организовать домашнюю лабу, но с чем они сталкиваются в первую очередь- это отсутствие помещение.

_________________
http://www.microscopist.info/


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 04 Jul 2012 17:17 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I - IV групп патогенности. Методические указания. МУ 1.3.2569-09

Методические указания предназначены для специалистов лабораторий, выполняющих работы с использованием методов амплификации нуклеиновых кислот (МАНК) при исследовании материала, содержащего (подозрительного на содержание) микроорганизмы I - IV групп патогенности.


Attachments:
ОРГАНИЗАЦИЯ РАБОТЫ ЛАБОРАТОРИЙ, ИСПОЛЬЗУЮЩИХ МЕТОДЫ АМПЛИФИКАЦИИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ ПРИ РАБОТЕ С МАТЕРИАЛОМ,СОДЕРЖАЩИМ МИКРООРГАНИЗМЫ I-IV ГРУПП ПАТОГЕННОСТИ.pdf [283.8 KiB]
Downloaded 940 times

_________________
http://www.microscopist.info/
Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 04 Jul 2012 17:18 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
Теоретические основы полимеразной цепной реакции
МОСКВА 1998


Attachments:
ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ.pdf [676.8 KiB]
Downloaded 856 times

_________________
http://www.microscopist.info/
Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 09 Jul 2012 01:37 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
Новое в клонировании ДНК. Методы
Image
Автор: Гловер Д. (ред.)
Аннотация:
Книга авторитетного коллектива авторов из Англии, США и ФРГ - третий том практического руководства по молекулярной биологии и генной инженерии. Описана техника использования различных векторов, новые эукариотические экспрессирующие системы, способы выделения некоторых продуктов экспрессии. Два первых тома руководства выпущены издательством "Мир" в 1988 г. (в одной книге).
Для молекулярных биологов, генетиков, биотехнологов.
http://chemistry-chemists.com/book5/biologija/Novoe_v_klonirovanii_DNK_Metody.djvu



Клонирование ДНК. Методы
Image
"Клонирование ДНК: Методы" - сборник новейших методов по генной инженерии, написанный выдающимися специалистами Великобритании, США, ФРГ, Италии и др. стран и удачно дополняющий современным материалом ранее изданного руководства по молекулярному клонированию (Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. - М.: Мир, 1984).
"Клонирование ДНК: Методы" для молекулярных биологов, генетиков, биотехнологов.
http://chemistry-chemists.com/book5/biologija/Klonirovanie_DNK_Metody.djvu

_________________
http://www.microscopist.info/


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 09 Jul 2012 18:54 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Кстати, я ж забыл карту плазмиды выложить. Благо к одной из плазмид карта прилагалась. Плюс по ссылке, где можно заказать бесплатные образцы есть полные сиквенсы плазмид(обеих, а не одной) и карты сайтов рестрикции(тоже для обеих).


Attachments:
File comment: Карта плазмиды.
map.jpeg
map.jpeg [ 472.45 KiB | Viewed 26232 times ]

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!
Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 10 Jul 2012 03:10 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
Камера для горизонтального электрофореза

http://labx.narod.ru/documents/gel_electrophoresis_systems.html

Image

Instructables tutorial for making a mini-gel electrophoresis system for DNA analysis. Gel electrophoresis systems are essential tools for any molecular biology research, but are often expensive to buy. The total cost of making this DIY system is around $50-$80, depending on where you source the laser cut acrylic parts.

Almost all of the assembly steps described in this tutorial require solvent welding the custom laser cut acrylic parts together using Weld-On #4, a fast-setting, clear, thin liquid cement. Weld-on is applied to the edge with a syringe applicator and drawn into the contact surfaces by capillary action. It is actually an easy and quick procedure, however, be sure to practice welding two scrap pieces of acrylic together if this a new technique to you.

The total length of time to complete assembly is 2-3 hours. Once complete, you will have the following parts:

- A UV-transmissive gel tray for casting a 7 x 7 cm mini-gel and comb;

- An electrophoresis chamber with lid.

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/0.125inch_clear_acrylic.pdf

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/0.125inch_clear_acrylic_0.pdf

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/0.25_inch_blue.pdf

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/0.25inch_clear_acrylic_0.pdf

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/Electrophoresis_Chamber.pdf

OpenSCAD - The Programmers Solid 3D CAD Modeller

Программу для просмотра 3D модели камеры, можно скачать на данном ресурсе: http://www.openscad.org/

Камера для горизонтального электрофореза модель в OpenSCAD
Image

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/assembled_gelbox.scad

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/assembled_tanklid.scad

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/assembled_tray.scad

Бесплатная профессиональная САПР для создания, редактирования просмотры файлов DWG.
Формат файла .dwg Файл базы данных чертежей AutoCAD

http://labx.narod.ru/Electrophoresis_camera/Electrophoresis_Chamber.dwg

С помощью DraftSight можно с легкостью создавать профессиональные чертежи САПР. DraftSight обеспечивает совместимость и возможности обмена со многими графическими и проектными программами по всему миру, т.к. использует в качестве первичного формата файла чертежа формат DWG, а также поддерживает версии файлов DWG и DXF, выпущенных до 2010 года.

_________________
http://www.microscopist.info/


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 10 Jul 2012 15:26 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Извлечение ДНК бытовой и аптечной химией в ДУ: http://learn.genetics.utah.edu/content/ ... ion/howto/

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 23 Jul 2012 19:49 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Ещё положительный опыт: векторы для клонирования генов. Брать отсюда: http://www.psparkcloning.com/web/index/samplerequest

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 23 Jul 2012 20:48 
Offline
.

Joined: 16 Aug 2010 17:38
Posts: 2041
ПЦРник
http://openpcr.org/
Ну или просто юзаный на eBay
http://www.ebay.com/sch/Analytical-Instruments-/26230/i.html?_nkw=pcr&_dcat=26230&rt=nc&LH_ItemCondition=3000

_________________
Думайте! Это патриотично.


Top
 Profile  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 26 Jul 2012 00:36 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Oleg wrote:

Зачем так сложно? Можно ж самим сделать. http://geneticlab.h19.ru/pribor/pcramp.php

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 26 Jul 2012 01:48 
Offline
.

Joined: 16 Aug 2010 17:38
Posts: 2041
Dorif wrote:
Oleg wrote:

Зачем так сложно? Можно ж самим сделать. http://geneticlab.h19.ru/pribor/pcramp.php

О! Да, такие самоделки одобряю и там действительно ничего сложного нету - можно даже лучше сделать, а не 0.5С/сек. Но не все дружат с паяльником и слесаркой, и не всем захочется тратить время на самопальный термоциклер, а не собственно на биологические опыты. А вообще, можно и манипулятор соорудить, который таскал бы кассету с пробирками меж двух термостатов, или самому поперетыкать с секундомером :)

_________________
Думайте! Это патриотично.


Top
 Profile  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 26 Jul 2012 15:42 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
http://www.biocellchallenge.com/ Предоставляют реагенты для трансфекции и переноса коротких интерференционных РНК. Естественно, доступны бесплатные образцы и они доходят без проблем до потребителя.)

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 05 Aug 2012 03:31 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Извлечение ДНК, электрофорез и прочее в домашних условиях: http://www.scq.ubc.ca/the-macgyver-proj ... materials/ Вместо этидиум бромида юзается метиленовый синий.

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
Display posts from previous:  Sort by  
Post new topic Reply to topic  [ 145 posts ]  Go to page 1, 2, 3, 4, 5 ... 8  Next

All times are UTC [ DST ]


Who is online

Users browsing this forum: No registered users and 40 guests


You cannot post new topics in this forum
You cannot reply to topics in this forum
You cannot edit your posts in this forum
You cannot delete your posts in this forum
You cannot post attachments in this forum

Search for:
Jump to:  

[Сообщить об ошибке, испорченном вложении, битой ссылке]
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group