На главную страницу сайта Опыты по химии Химический Юмор. Научный Юмор Опыты по физике    



Форум Химиков - Энтузиастов. Химия и Химики

Эксперименты по Химии - Практическая Химия - Книги по Химии - Физика – Астрономия – Биология – Научный Юмор
Прежде чем отправить свое сообщение - ознакомьтесь с ПРАВИЛАМИ ФОРУМА.
Прежде чем создать новую тему - воспользуйтесь ПОИСКОМ, возможно, аналогичная тема уже есть

All times are UTC [ DST ]




Post new topic Reply to topic  [ 145 posts ]  Go to page Previous  1, 2, 3, 4, 5 ... 8  Next
Author Message
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 26 Aug 2012 21:29 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
caissonlabs.com - можно заказать бесплатные образцы всего ассортимента продукции. Меня интересовали агар и LB среда. Всё пришло: 2 пакетика агара по 9 грамм, 1 пакеик для приготовления литра жидкой и один - для литра твёрдой среды. Организацию указывать не обязательно: вам просто пишет на емейл их представитель и спрашивает адрес и чем вы занимаетесь. Вот собственно и всё - просто, быстро, надёжно.

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 24 Sep 2012 21:03 
Offline
Ветеран
Ветеран
User avatar

Joined: 14 Feb 2010 20:45
Posts: 822
Location: Украина, Луганск
Анимация на буржуйском языке по теме репликация ДНК.
http://www.wiley.com/college/pratt/0471393878/student/animations/dna_replication/index.html


Top
 Profile  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 26 Sep 2012 12:35 
Offline
Ветеран
Ветеран
User avatar

Joined: 18 Apr 2010 19:26
Posts: 923
Location: Кострома-Калуга
Pitman wrote:
Анимация на буржуйском языке по теме репликация ДНК.
http://www.wiley.com/college/pratt/0471393878/student/animations/dna_replication/index.html


Очень долго искал обычную gif-анимацию репликации ДНК, но так не нашёл, жаль.

_________________
С уважением,Глущенко Антон.


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 22 Feb 2013 22:50 
Offline
Посетитель
Посетитель
User avatar

Joined: 12 Jan 2013 16:24
Posts: 5
Народ - кто как решает проблему с приобретением рестриктаз и лигаз? Суда по литературе самому получать их достаточно долгий и муторный процесс, к тому же без гарантии положительного результата..


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 23 Feb 2013 03:03 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
покупаю, другой варианта отсутствует. самому трудоемко много реактивов, оборудование, ну и выход небольшой . покупал тут ( сейчас не знаю продают ли частникам) http://www.helicon.ru/catalog/section.p ... ION_ID=278
хорошая тема трансгены на дому_

_________________
http://www.microscopist.info/


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 23 Feb 2013 15:23 
Offline
Посетитель
Посетитель
User avatar

Joined: 12 Jan 2013 16:24
Posts: 5
Спасибо за оперативный ответ и за ссылку!

Будем разбираться в их номенклатуре, что конкретно под поставленные задачи подходит..


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 23 Feb 2013 16:28 
Offline
Начинающий
Начинающий

Joined: 21 Feb 2013 21:11
Posts: 34
Мне попался интересный сайт с моделями http://visualscience.ru/ .
Там есть 3d модели вирусов.


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 04 Mar 2013 22:45 
Offline
Посетитель
Посетитель
User avatar

Joined: 12 Jan 2013 16:24
Posts: 5
В процессе освоения темы возник вопрос - если с алгоритмом выбора рестриктаз всё более менее понятно (выбирается под конкретную задачу-плазмиду), то с лигазами вопрос не разрешается: они универсальны и способны сшивать любые липкие концы или здесь тоже есть своя хитрость?


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 05 Mar 2013 00:32 
Offline
Участник
Участник

Joined: 24 Oct 2011 14:43
Posts: 162
Location: Украина
Dorif wrote:
caissonlabs.com - можно заказать бесплатные образцы всего ассортимента продукции. Меня интересовали агар и LB среда. Всё пришло: 2 пакетика агара по 9 грамм, 1 пакеик для приготовления литра жидкой и один - для литра твёрдой среды. Организацию указывать не обязательно: вам просто пишет на емейл их представитель и спрашивает адрес и чем вы занимаетесь. Вот собственно и всё - просто, быстро, надёжно.

А как там заказать бесплатные образцы? И если я школьник, что мне им написать, когда будут спрашивать-чем занимаетесь?


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 06 Mar 2013 00:34 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Triumfator wrote:
Dorif wrote:
caissonlabs.com - можно заказать бесплатные образцы всего ассортимента продукции. Меня интересовали агар и LB среда. Всё пришло: 2 пакетика агара по 9 грамм, 1 пакеик для приготовления литра жидкой и один - для литра твёрдой среды. Организацию указывать не обязательно: вам просто пишет на емейл их представитель и спрашивает адрес и чем вы занимаетесь. Вот собственно и всё - просто, быстро, надёжно.

А как там заказать бесплатные образцы? И если я школьник, что мне им написать, когда будут спрашивать-чем занимаетесь?

Найдите интересующий вас продукт. Сбоку будет баннер
Quote:
NOW YOU CAN
TRY IT
BEFORE YOU
BUY IT

Под баннером - форма для данных. Заполните её и нажмите кнопку Request Sample. Ждите емейл. Отвечайте честно - они терпеть не могут вранья. Пишите, что школьник, что делаете школьный проект(на всякий случай - сделайте реально школьный проект - и интересно, и познавательно, и для оценки по биологии и химии полезно), что ищите, у кого можно дёшево брать компоненты для сред. У них реально дёшево. Они пришлют немножечко на пробу того, что заказывали и могут что-то ещё приятное положить. Пробнички у них классные - после этого реально захочется купить, благо там, как я уже сказал - недорого.

Что классного в американских компаниях - они ответственно подходят к своему делу и чаще всего поддерживают энтузиастов.

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 11 Mar 2013 06:04 
Offline
Участник
Участник
User avatar

Joined: 10 Mar 2013 19:12
Posts: 205
Quote:
Кстати, нашёл где достать бесплатные образцы плазмид для опытов с E. coli: http://www.aldevron.com/products/dnas/plasmids/ Заказал. Мне вот сейчас пришли образцы pRc/CMV-Hbs(S) и pCMVHB-S2.S.

К сожалению, поле заполнения формы выдаёт ошибку.
Кому-то в последнее время удавалось раздобыть у них плазмиды?

Quote:
По большому счету, в научных исследованиях у себя дома нет ничего экстраординарного.

Более того, в ближайшем будущем биотехнология начнет входить как хобби в массы аналогично радиолюбительству когда-то.
А компании просто мечтают, чтоб поскорее это произошло, так как рынок увеличится многократно, и максимально этому способствуют.
В продаже уже полно наборов “юный генетик”
Quote:
Одно плохо: не знаю, где буферы Гуда взять

Да в любой химфирме под заказ.
тут есть трисы например.
http://www.yugsintez.dp.ua (сайт иногда глючит)
Также не стоит из Америки заказывать питательные среды.
Агар для сред можно взять пищевой на любой фирме
http://ingredient.com.ua/agar.html вот тут примерно 120 грн/кг
и составлять любые среды на свое усмотрение.
Из практики на таком агаре отлично растут бактерии, грибы, растения.


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 17 Mar 2013 01:44 
Offline
Участник
Участник

Joined: 01 Apr 2010 16:07
Posts: 205
Location: Москва
Наконец купил амплификатор.

Амплификатор — прибор, обеспечивающий периодическое охлаждение и нагревание пробирок, обычно с точностью не менее 0,1 °C и необходимый для проведения полимеразной цепной реакции. Амплификатор используется в молекулярной биологии для амплификации ДНК методом полимеразной цепной реакции.


Attachments:
IMG_0435.JPG
IMG_0435.JPG [ 1.31 MiB | Viewed 14670 times ]
File comment: Techgene OPERATOR’S MANUAL
techne_techgene-76472.pdf [275.31 KiB]
Downloaded 573 times

_________________
http://www.microscopist.info/
Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 28 Apr 2013 20:44 
Offline
Участник
Участник
User avatar

Joined: 10 Mar 2013 19:12
Posts: 205
Quote:
Меня интересовали агар и LB среда. Всё пришло: 2 пакетика агара по 9 грамм, 1 пакеик для приготовления литра жидкой и один - для литра твёрдой среды.

Так у них там агароза для фореза.
И как она себя показала?

Заказал у них линейки, уже пришли.


http://cheapassscience.wordpress.com/category/gels/
немного по бюджетным буферам и гелям.
особенно камера для фореза из лего порадовала)


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 05 Jun 2013 21:15 
Offline
Участник
Участник
User avatar

Joined: 10 Mar 2013 19:12
Posts: 205
GFP
Карта плазмиды в pdf

В первой чашке посев получился слишком плотный, потому фоткал без крышки.


Attachments:
File comment: GfpMaps
GfpMaps.pdf [12.96 KiB]
Downloaded 505 times
File comment: GFP
gfp-2.jpg
gfp-2.jpg [ 250.48 KiB | Viewed 14529 times ]
File comment: GFP
IMG_1655.JPG
IMG_1655.JPG [ 3.78 MiB | Viewed 14529 times ]
Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 25 Jan 2014 18:47 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Вопрос: ДНК при pH 4,7 - 4,8 (оптимум активности имеющейся протеазы) достаточно стабильна? Протеаза для очистки от белков юзается.

Спасибо!

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 25 Jan 2014 20:39 
Offline
Модератор
Модератор
User avatar

Joined: 17 Nov 2009 04:45
Posts: 12797
Location: г. Волгоград
Dorif wrote:
Вопрос: ДНК при pH 4,7 - 4,8 (оптимум активности имеющейся протеазы) достаточно стабильна? Протеаза для очистки от белков юзается.

Спасибо!

Возможность протонирования амино- и имино- групп, участвующих в образовании водородных связей между комплементарными основаниями ДНК, объясняет различные стабильности ДНК в зависимости от рН раствора. Эта зависимость колоколообразная, и ДНК наиболее стабильна при pH ≤ 7 . Для разбавления ДНК используется цитратный буферный раствор. Сокращенно обозначаемыйSSC. Раствор 0,1 SSC содержит 0,15 М NaCl и 0,015 M трехзамещенного лимонного натрия.
Концентрация катионов Na в таком растворе составляет 0,195 М.

_________________
Accidit in puncto quod non speratur in anno


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 29 Jan 2014 22:03 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Интересный вопрос: в плазмидах, экспрессирующих свои гены в клетках млекопитающих участок начала репликации в клетках млекопитающих где расположен? Участок начала репликации в бактериальных клетках, как правило представляет собой отдельную открытую рамку считывания, но для репликации в клетках млекопитающих ничего подобного не нашёл.

Этот участок начала репликации может внутри промотора находиться? Например - внутри промотора цитомегаловируса в плазмидах pCMV-S, pCMVHB-S2.S. Карта pCMV-S ниже. Бледным сине-зелёным цветом выделен промотор цитомегаловирусный, красным - участок начала репликации pUC, насыщенным зелёным - ColE1.


Attachments:
pCMV-S map.png
pCMV-S map.png [ 3.1 MiB | Viewed 14132 times ]

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!
Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 29 Jan 2014 23:22 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Переформулирую.

Есть вот плазмиды pCMV-S и pCMVHB-S2.S. Для репликации в бактериях у них есть участок начала репликации pUC ori. А как они в клетках млекопитающих реплицируются? Ведь они нацелены как раз на работу в клетках млекопитающих(гены белков вируса гепатита Б, которые предполагается экспрессировать, находятся под контролем цитомегаловирусного промотора). Но ничего похожего на участок начала репликации в эукариотных клетках я не вижу.

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 30 Jan 2014 10:23 
Offline
Модератор
Модератор
User avatar

Joined: 17 Nov 2009 04:45
Posts: 12797
Location: г. Волгоград
Во всей литературе которую встречал сказано, что механизм до конца не изучен. Причем в разных клетках репликация идет по разному, что дает основания полагать об использовании комформаций и др структурных особенностей ДНК.

_________________
Accidit in puncto quod non speratur in anno


Top
 Profile E-mail  
 
 Post subject: Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
PostPosted: 27 Feb 2014 18:32 
Offline
Гуру
Гуру
User avatar

Joined: 26 Jan 2012 23:34
Posts: 1169
Location: Кишинёв, Молдова
Вопрос: если в методиках, по которым нужен ПЭГ 6000 использовать ПЭГ 1500(есть только он у меня) - что изменится от этого? Спасибо!

_________________
Сыплется с неба пепел взрывов,
Ночь за окном темна.
Вот и пришла моя погибель -
Ядерная война!


Top
 Profile E-mail  
 
Display posts from previous:  Sort by  
Post new topic Reply to topic  [ 145 posts ]  Go to page Previous  1, 2, 3, 4, 5 ... 8  Next

All times are UTC [ DST ]


Who is online

Users browsing this forum: No registered users and 167 guests


You cannot post new topics in this forum
You cannot reply to topics in this forum
You cannot edit your posts in this forum
You cannot delete your posts in this forum
You cannot post attachments in this forum

Search for:
Jump to:  

[Сообщить об ошибке, испорченном вложении, битой ссылке]
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group